La INTOSAI realiza sus tareas con la ayuda de varios órganos, programas y acontecimientos. Los órganos de la INTOSAI son:

• Congreso,

• Comité Directivo,

• Secretaría General y

• Grupos Regionales de Trabajo.

La Comisión Financiera y Administrativa sirve para la preparación de decisiones del Comité Directivo.

El Director de Planificación Estratégica garantiza una eficiente coordinación y la implementación del Plan Estratégico.